Smart Medical Imaging

EPSRC Centre for Doctoral Training

Students

List of current student publications

Samy Abo Seada

Joanna Bartnicka

Patrick Bergstrom Mann

James Bland

Christopher Bowles

  • Pseudo-healthy image synthesis for white matter lesion segmentation                                                                                                                        Authors: Bowles, C., Qin, C., Ledig, C., Guerrero, R., Gunn, R., Hammers, A., … Rueckert, D. (2016).                                                                             In: Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) (Vol. 9968 LNCS, pp. 87–96).
  • A semi-supervised large margin algorithm for white matter hyperintensity segmentation
    Authors: Qin, C., Moreno, R. G., Bowles, C., Ledig, C., Scheltens, P., Barkhof, F., … Rueckert, D. (2016).
    In: Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) (Vol. 10019 LNCS, pp. 104–112).

Jemma Brown

Adela Capilnasiu

Joseph Downey

Sam Ellis

Peter Gawne

Olivier Jaubert

  • Rigid Motion Corrected Magnetic Resonance Fingerprinting
    Authors: Lima da Cruz, G. J., Jaubert, O. F., Schneider, T., Botnar, R. M. & Prieto Vasquez, C.                                                                                        In : Magnetic Resonance in Medicine, 2018, DOI: 10.1002/mrm.27448

Karina Lopez

Pedro Luque-Laguna

  • The challenge of mapping the human connectome based on diffusion tractography
    Authors: Maier-Hein, K. H. , Neher, P. F. , Houde, J-C. , Côté, M-A. , Garyfallidis, E. , Zhong, J. , Chamberland, M. , Yeh, F-C. , Lin, Y-C. , Ji, Q. , Reddick, W. E. , Glass, J. O. , Chen, D. Q. , Feng, Y. , Gao, C. , Wu, Y. , Ma, J. , Renjie, H. , Li, Q. , Westin, C-F. & 57 others                                      In : Nature communications, 2017, 8, 1, p. 1349

Federico Luzi

Jorge Mariscal-Harana

  • Optimization of topological complexity for 1D arterial blood flow models
    Authors: Fossan, F. E., Mariscal Harana, J., Alastruey-Arimon, J. & Hellevik, L. R.                                                                                                          In : Journal Of The Royal Society Interface, 2018, In press.

Sophie Morse

  • Rapid short pulse ultrasound delivers drugs uniformly across the murine blood-brain barrier with negligible disruption                            Authors: Morse, S.V., Pouliopoulos, A.N., Chan, T.G., Copping, M.J., Lin, J, Long, N.J., Choi, J.J.                                                                                       In: Radiology, 2019, In press
  • Targeted delivery of DNA-Au nanoparticles across the Blood-Brain Barrier using focused ultrasound                                                                   Authors: Chan, T.G., Morse, S.V., Copping, M.J., Choi, J.J, Vilar, R.                                                                                                            In: ChemMedChem., 2018, 13 1311-1314.

Camila Munoz Escobar

  • Respiratory‐ and cardiac motion‐corrected simultaneous whole‐heart PET and dual phase coronary MR angiography                                        Authors: Munoz, C., Neji, R., Kunze, K. P., Nekolla, S. G., Botnar, R. M. & Prieto Vasquez, C.                                                                                      In: Magnetic Resonance in Medicine (2018), DOI: 10.1002/mrm.27517
  • Non-contrast enhanced simultaneous 3D whole-heart bright-blood pulmonary veins visualization and black-blood quantification of atrial wall thickness                                                                                                                                                                                                                    Authors: Ginami, G., Lòpez, K., Mukherjee, R. K., Neji, R., Munoz, C., Roujol, S., Mountney, P., Razavi, R., Botnar, R. M. & Prieto, C.                        In: Magnetic Resonance in Medicine (2018), DOI: https://doi.org/10.1002/mrm.27472
  • Accelerated 3D T2 Mapping with Dictionary-Based Matching for Prostate Imaging                                                                                                Authors: Roccia, E., Vidya Shankar, R., Neji, R., Lima da Cruz, G., Munoz, C., Botnar, R., Goh, V., Prieto, C. & Dregely, I.                                         In: Magnetic resonance in medicine (2018), In press
  • Motion-corrected whole-heart PET-MR for the simultaneous visualisation of coronary artery integrity and myocardial viability: an initial clinical validation                                                                                                                                                                                                                              Authors: Munoz, C.; Kunze, K.P.; Neji, R.; Vitadello, T.; Rischpler, C.; Botnar, R.M.; Nekolla, S.G.; Prieto, C.                                                                In: European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging (2018); DOI:10.1007/s00259-018-4047-7
  • Motion-Corrected Simultaneous Cardiac PET and Coronary MR Angiography with High Acquisition Efficiency
    Authors: Munoz, C.; Neji, R.; Cruz, G.; Mallia, A.; Jeljeli, S.; Reader, A.J.; Botnar, RM.; Prieto, C.
    In: Magnetic Resonance in Medicine; DOI:10.1002/mrm.26690, 2017

Giovanna Nordio

Esther Puyol-Anton 

Isabel Ramos

  • Simultaneous Assessment of Cardiac Inflammation and Extracellular Matrix Remodeling After Myocardial Infarction                                          Authors: Ramos, I. T., Henningsson, M., Nezafat, M., Lavin, B., Lorrio, S., Gebhardt, P., Protti, A., Eykyn, T. R., Andia, M. E., Floögel, U., Phinikaridou, A., Shah, A. M. & Botnar, R. M.                                                                                                                                                                    In : Circulation: Cardiovascular Imaging, 2018, 11, 11, e007453
  • Improved segmented modified Look-Locker inversion recovery T1 mapping sequence in mice.                                                                                Authors: Nezafat, M., Ramos, I. T., Henningsson, M., Protti, A., Basha, T. & Botnar, R. M.                                                                                   In : PloS one. 12, 11, p. e0187621

Rob Robinson

  • Real-Time Prediction of Segmentation Quality                                                                                                                                                        Authors: Robinson, R., Oktay, O., Bai, W., Valindria, V.V., Sanghvi, M.M.,  Aung, N., Paiva, J. M.,  Zemrak, F., K. Fung, F., Lukaschuk, E., Lee, A. M., Carapella, V., Kim, Y. J., Kainz, B., Piechnik, S. K., Neubauer, S., Petersen, S. E.,Page, C., Rueckert, D., Glocker. B.                                      In: Frangi A., Schnabel J., Davatzikos C., Alberola-López C., Fichtinger G. (eds) Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018. MICCAI 2018. Lecture Notes in Computer Science, vol 11073. Springer, Cham. DOI: 10.1007/978-3-030-00937-3_66
  • Automatic Quality Control of Cardiac MRI Segmentation in Large-Scale Population Imaging
    Authors: Robinson, R., Valindria, V. V., Bai, W., Suzuki, H., Matthews, P. M., Page, C., Rueckert, D., Glocker, B.
    In:  Descoteaux M., Maier-Hein L., Franz A., Jannin P., Collins D., Duchesne S. (eds) Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention − MICCAI 2017. MICCAI 2017. Lecture Notes in Computer Science, vol 10433. Springer, Cham. DOI: 10.1007/978-3-319-66182-7_82

Elisa Roccia

  • Accelerated 3D 1 mm isotropic T2w-Imaging of the Prostate in less than 3 min                                                                                                     Authors: Vidya Shankar, R., Roccia, E., Lima da Cruz, G., Neji, R., Botnar, R., Prezzi D., Goh, V., Prieto, C. & Dregely, I.                                          In: Magnetic Resonance in Medicine, submitted.
  • Accelerated 3D T2 Mapping with Dictionary-Based Matching for Prostate Imaging
    Authors: Roccia, E., Vidya Shankar, R., Neji, R., Lima da Cruz, G., Munoz, C., Botnar, R., Goh, V., Prieto, C. & Dregely, I.                                            In: Magnetic resonance in medicine, 2018, In press.
  • Imaging Biomarkers in Oncology: Basics and Application to Magnetic Resonance Imaging (MRI)

    Authors: Dregely, I. M. A., Prezzi, D., Kelly-Morland, C., Roccia, E., Neji, R. & Goh, V. J-L.                                                                                              In: Journal of Magnetic Resonance Imaging, 2018, . 48, 1, p. 13-26

Aditi Roy

Cian Scannell

  • Importance of operator training and rest perfusion on the diagnostic accuracy of stress perfusion cardiovascular magnetic resonance
    Authors: Villa, A. D. M., Corsinovi, L., Ntalas, I., Milidonis, X., Scannell, C., Di Giovine, G., Child, N., Ferreira, C., Nazir, M. S., Karady, J., Eshja, E., De Francesco, V., Bettencourt, N., Schuster, A., Ismail, T. F., Razavi, R. & Chiribiri, A.                                                                                                      In : Journal of cardiovascular magnetic resonance : official journal of the Society for Cardiovascular Magnetic Resonance, 2018. 20, 1.
  • Importance of operator training and rest perfusion on the accuracy of stress perfusion cardiovascular magnetic resonance

    Authors: Villa, A., Corsinovi, L., Ntalas, I., Milidonis, X., Scannell, C. M., Di Giovine, G., Child, N. J. A., Ferreira, C., Nazir, M. S., Karády, J., Eshja, E., De Francesco, V., Bettencourt, N., Schuster, A., Ismail, T. F., Razavi, R. & Chiribiri, A.                                                                                              In : Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance, 2018, In press.

Adam Smith

Marina Strocchi

  • The Effect of the Pericardium on Ventricular Systolic Motion: a Computational Modelling Study.                                                                  Authors: Strocchi M., Gsell M. A. F., Augustin C. M., Razeghi O., Roney C. H., Prassl A. J., Vigmond E. J., Behar J. M., Gould J S, Rinaldi C. A., Plank G., Bishop M. J., Niederer S. A.                                                                                                                                                                              In: Biomechanics and Modeling in Mechanobiology, Submitted
  • Computational Modeling for Cardiac Resynchronization Therapy.
    Authors: Lee, A. W., Costa, C. M., Strocchi, M., Rinaldi, C. A., & Niederer, S. A.
    In: Journal of cardiovascular translational research, 1-17, 2018

Samuel Vennin

Jennifer Young